三標(biāo)一體化過程中，由于QMS、EMS、OHSMS三個體系在管理目的、對象的特點(diǎn)不同，三個標(biāo)準(zhǔn)之間存在著較大的差異，管理體系及其要素的應(yīng)用因不同的目的和不同相關(guān)方而異。QMS針對的是顧客的需要，EMS服務(wù)于眾多的相關(guān)方的需要和社會對環(huán)境保護(hù)不斷發(fā)展的需要，OHSMS服務(wù)于職業(yè)健康安全條件影響的企業(yè)內(nèi)部員工和外部來訪者，三個體系自成系統(tǒng)，各司其職。
　　加工企業(yè)內(nèi)負(fù)責(zé)質(zhì)量管理、環(huán)境保護(hù)和安全衛(wèi)生的不是一個部門，因此，在實(shí)施體系時大都采用了各自獨(dú)立的體系，體系之間沒有或很少有交叉，這種多體系和大量重復(fù)文件的情況導(dǎo)致管理效率降低，相同的工作多次重復(fù)，難以控制和實(shí)施。在三標(biāo)一體化的過程一掃要注意避免產(chǎn)生此問題。

　　三標(biāo)一體化過程中，對管理系統(tǒng)初始狀態(tài)評審不夠全面、完整。在建立一體化管理體系之前，應(yīng)對管理現(xiàn)狀進(jìn)行評審。主要包括評價(jià)現(xiàn)存的組織機(jī)構(gòu)、職責(zé)分配、資源配置、規(guī)章制度、標(biāo)準(zhǔn)慣例等的有效性和適宜性識別和確定一體化管理體系控制的對象（包括產(chǎn)品生產(chǎn)和管理過程、產(chǎn)品和活動中的重要環(huán)境因素、職業(yè)安全健康重大危險(xiǎn)源/風(fēng)險(xiǎn)因素）；
　　明確企業(yè)應(yīng)遵守的相關(guān)法律法規(guī)和要求，并對照現(xiàn)有生產(chǎn)管理水平、環(huán)境表現(xiàn)和職業(yè)安全績效以及各種信息反饋（如事故、事件、不符合情況等），進(jìn)行評價(jià)，找出差距，提出改進(jìn)需求，為建立一體化管理體系打好基礎(chǔ)。

　　三標(biāo)一體化過程中，容易對原有的管理模式簡單地融合進(jìn)來，出現(xiàn)”兩張皮”現(xiàn)象。所有“貫標(biāo)”企業(yè)，在建立體系之前都客觀存在著傳統(tǒng)模式的管理體系，而且在以前的“貫標(biāo)”過程，實(shí)際上就是將現(xiàn)有的管理體系按國際通用標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化、程序化的改造完善過程，不可能也無必要摒棄原來行之有效的管理手段和方法，重搞一套。
　　所以，面臨的任務(wù)是如何在現(xiàn)有管理體系的基礎(chǔ)上，盡快完成這個改造過程，建立一個更加適宜有效的嶄新的管理體系。在這個過程中，不可避免地會出現(xiàn)新舊管理方式并存或脫節(jié)的“兩張皮”現(xiàn)象。